Μια ημικρανία με κυρίαρχα συμπτώματα αύρας εγκεφαλικού στελέχους είναι γνωστή ως βασική ημικρανία.
Άλλα ονόματα για αυτό είναι ημικρανία βασικής αρτηρίας, ημικρανία βασικού τύπου, ημικρανία εγκεφαλικού στελέχους, σπονδυλική ημικρανία και ημικρανία Bickerstaff. Ονομάστηκε βασική ημικρανία επειδή πιστεύεται ότι προκαλείται από σπασμό της βασικής αρτηρίας. Ωστόσο, δεν υπάρχουν αποδεδειγμένες ενδείξεις αγγειακής παθολογίας για βασική ημικρανία, και τώρα πιστεύεται ότι οφείλεται στην πυροδότηση των νεύρων στο εγκεφαλικό στέλεχος. Τώρα αναγνωρίζεται ως υποτύπος ημικρανίας με αύρα και ονομάζεται κατά προτίμηση «ημικρανία με αύρα εγκεφαλικού στελέχους».
Η αύρα αναφέρεται σε βραχύβια αισθητικά συμπτώματα που παρουσιάζονται λίγο πριν ή κατά τη διάρκεια του οξέος επεισοδίου ημικρανίας. Περίπου το ένα τέταρτο όλων των ασθενών με ημικρανία εμφανίζουν τυπικά συμπτώματα αύρας. Η ημικρανία με αύρα εγκεφαλικού στελέχους (βασική ημικρανία) είναι ένας σπάνιος υποτύπος ημικρανίας με αύρα που εκδηλώνεται με συμπτώματα που προέρχονται από το εγκεφαλικό στέλεχος ή και τα δύο εγκεφαλικά ημισφαίρια ταυτόχρονα.
Η ακριβής αιτιολογία της ημικρανίας με αύρα εγκεφαλικού στελέχους δεν είναι γνωστή. Όπως και άλλοι τύποι ημικρανιών, οι περιβαλλοντικοί παράγοντες παίζουν ρόλο. Ο γενετικός ρόλος προτείνεται, αλλά δεν έχει βρεθεί ακόμη σαφής σύνδεση. Οι συνήθεις παράγοντες πυροδότησης (όπως σε άλλους τύπους ημικρανίας) περιλαμβάνουν έντονες μυρωδιές, δυνατούς θορύβους, αλλαγές καιρού, υπερβολικό ύπνο, έλλειψη ύπνου, αυξημένο στρες, έντονη σωματική άσκηση, από του στόματος αντισυλληπτικά, τροφές όπως τυρί, αλκοόλ, καφεΐνη και ορισμένα συντηρητικά τροφίμων όπως γλουταμινικό μονονάτριο (MSG).